Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE1P24864 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms