Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AMPD1P23109 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AMPD1P23109 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms