Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK11BP21127 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms