Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD247P20963 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD247P20963 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD247P20963 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD247P20963 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD247P20963 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD247P20963 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD247P20963 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD247P20963 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD247P20963 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD247P20963 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD247P20963 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms