Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASTP20810 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASTP20810 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASTP20810 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASTP20810 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASTP20810 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CASTP20810 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASTP20810 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASTP20810 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASTP20810 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASTP20810 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASTP20810 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASTP20810 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASTP20810 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASTP20810 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms