Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP4AP20648 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms