Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CXCL3P19876 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL3P19876 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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