Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERCC3P19447 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC3P19447 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERCC3P19447 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms