Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATF4P18848 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATF4P18848 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATF4P18848 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATF4P18848 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATF4P18848 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATF4P18848 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms