Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHCEP18577 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHCEP18577 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHCEP18577 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RHCEP18577 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHCEP18577 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHCEP18577 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHCEP18577 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHCEP18577 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHCEP18577 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RHCEP18577 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHCEP18577 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHCEP18577 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RHCEP18577 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms