Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN2P17655 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN2P17655 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms