Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3L1P16619 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms