Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPB42P16452 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPB42P16452 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPB42P16452 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPB42P16452 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPB42P16452 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPB42P16452 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB42P16452 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB42P16452 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPB42P16452 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPB42P16452 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPB42P16452 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms