Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG1P15918 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG1P15918 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG1P15918 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG1P15918 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAG1P15918 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG1P15918 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG1P15918 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG1P15918 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG1P15918 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG1P15918 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG1P15918 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAG1P15918 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG1P15918 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms