Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH1P12830 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH1P12830 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH1P12830 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH1P12830 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH1P12830 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH1P12830 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH1P12830 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH1P12830 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH1P12830 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH1P12830 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms