Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP2C9P11712 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP2C9P11712 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms