Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF1P10914 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF1P10914 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF1P10914 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF1P10914 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF1P10914 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF1P10914 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF1P10914 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF1P10914 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF1P10914 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF1P10914 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF1P10914 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF1P10914 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms