Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARBP10826 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARBP10826 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARBP10826 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARBP10826 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARBP10826 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RARBP10826 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARBP10826 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARBP10826 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARBP10826 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms