Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RD3LP0DJH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms