Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC166P0CW27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms