Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC172P0C7W6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC172P0C7W6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC172P0C7W6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms