Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDGFRBP09619 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDGFRBP09619 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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