Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSP01100 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSP01100 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOSP01100 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOSP01100 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSP01100 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSP01100 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSP01100 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSP01100 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOSP01100 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FOSP01100 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FOSP01100 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOSP01100 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FOSP01100 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSP01100 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSP01100 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSP01100 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSP01100 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FOSP01100 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSP01100 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSP01100 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSP01100 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSP01100 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FOSP01100 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FOSP01100 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms