Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBX18O95935 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBX18O95935 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBX18O95935 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBX18O95935 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TBX18O95935 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX18O95935 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX18O95935 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX18O95935 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX18O95935 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBX18O95935 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBX18O95935 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBX18O95935 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms