Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCNTO95613 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCNTO95613 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCNTO95613 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCNTO95613 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCNTO95613 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCNTO95613 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCNTO95613 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCNTO95613 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNTO95613 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNTO95613 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNTO95613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCNTO95613 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCNTO95613 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms