Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF12O95522 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms