Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKAP2O75563 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms