Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP12O75317 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP12O75317 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP12O75317 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP12O75317 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP12O75317 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP12O75317 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP12O75317 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP12O75317 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP12O75317 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP12O75317 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP12O75317 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP12O75317 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
USP12O75317 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP12O75317 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP12O75317 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms