Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF10O60809 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF10O60809 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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