Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLR5O60602 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLR5O60602 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLR5O60602 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLR5O60602 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLR5O60602 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLR5O60602 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TLR5O60602 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLR5O60602 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLR5O60602 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms