Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR3O43761 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYNGR3O43761 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms