Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTN4O43707 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTN4O43707 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTN4O43707 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms