Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT7O43581 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYT7O43581 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYT7O43581 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYT7O43581 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SYT7O43581 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SYT7O43581 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SYT7O43581 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms