Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPK2O43353 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPK2O43353 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPK2O43353 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms