Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PHGDHO43175 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHGDHO43175 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms