Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLXNB1O43157 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PLXNB1O43157 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms