Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF1O15321 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF1O15321 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM9SF1O15321 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM9SF1O15321 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM9SF1O15321 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms