Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPLO15194 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTDSPLO15194 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms