Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ARPC1BO15143 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARPC1BO15143 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms