Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCF2LO15068 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCF2LO15068 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms