Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASKO14936 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASKO14936 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASKO14936 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASKO14936 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASKO14936 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASKO14936 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASKO14936 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms