Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX39AO00148 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX39AO00148 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms