Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBXN8O00124 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN8O00124 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms