Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms