Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
STX16-NPEPL1H3BU86 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms