Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms