Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQF6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQF6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BQF6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BQF6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H3BQF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H3BQF6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H3BQF6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BQF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BQF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
H3BQF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H3BQF6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H3BQF6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H3BQF6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H3BQF6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms