Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM49D1C9J1S8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM49D1C9J1S8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms