Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZSWIM8A7E2V4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM8A7E2V4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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