Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C4orf47A7E2U8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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